Die wichtigsten Schritte der endodontischen Therapie sind die Präparation, Reinigung und Desinfektion des Wurzelkanalsystems sowie der bakteriendichte Verschluss. Ein optimales Desinfektionskonzept sollte vor allem die mikrobiologische Ausgangssituation berücksichtigen, bei der zwischen infizierten und nicht infizierten Wurzelkanälen differenziert wird. Der Beitrag beschreibt die Eigenschaften, Interaktionen und Limitationen verschiedener Spülflüssigkeiten und medikamentöser Einlagen. Darüber hinaus wird die schall- und ultraschallgestützte Aktivierung der Spüllösung erläutert sowie ihre Effektivität diskutiert. Abschließend werden Spül- und Desinfektionsprotokolle für verschiedene klinische Situationen empfohlen. Keywords: Wurzelkanaldesinfektion, Desinfektionsprotokolle, Spülflüssigkeiten, medikamentöse Einlage