Jede Wurzelkanalaufbereitung führt zu einer Veränderung der Anatomie des Wurzelkanalsystems. Die Darstellung dieser Veränderungen erfolgte bisher meist zweidimensional unter Zerstörung der Kontinuität der Wurzelanatomie. In dieser Studie sollte die Genauigkeit von zerstörungsfreien dreidimensionalen Messungen der Wurzelkanalanatomie mittels hochauflösender Computertomographie (µCT) dargestellt werden. Mit einem µCT wurden 5 OK-Molaren je zweimal gescannt und dreidimensional rekonstruiert. Die technisch mögliche Auflösung stellte maximal kubische Voxel von 34 µm dar. Ein spezieller Halter ermöglichte die exakte Repositionierung der Proben bei der zweiten Messung. Mittels spezieller Software wurden Kanalvolumen und Kanaloberfläche der einzelnen Wurzelkanäle vom apikalen Foramen bis zum Boden des Pulpenkavums bestimmt. Mit Wurzeldentinscheiben, die mit einer zylindrischen Bohrung (n = 3) versehen waren, wurde die Eichung des Systems geprüft. Die Messungen ergaben mittlere Volumina von 2,17 - 7,55 mm³ für palatinale, mesiobukkale und distobukkale Wurzeln. Die entsprechenden mittleren Kanaloberflächen betrugen 18,43 - 31,91 mm². Wiederholte Messungen zeigten sehr geringe systematische Messfehler hinsichtlich Volumina und Flächen. Die Analyse des Dentinstandards ergab eine hohe Übereinstimmung der berechneten und gemessenen Werte. Die vorliegenden Daten zeigen, dass sich die Darstellung von Wurzelkanälen mit dem µCT sehr gut zur dreidimensionalen Erfassung der Anatomie eignet. Die Veränderung der Kanalgeometrie durch die Kanalpräparation kann mit dem dargestellten System mit hoher Genauigkeit erfolgen. Daher erscheint der Vergleich verschiedener Aufbereitungstechniken mit dem vorgestellten System sinnvoll.