Das intrakanaläre Mikrobiom ist ein wesentlicher Faktor einer persistierenden oder refraktären apikalen Parodontitis. Das Wissen um die im reinfizierten Kanal vorkommenden Bakterienarten kann helfen, die Therapie entsprechend anzupassen und zu optimieren. Der folgende Beitrag gibt einen Überblick über den Stand und die Problematik der Nachweistechniken und zum Kenntnisstand über das Mikrobiom bei sekundärer oder persistierender Parodontitis apicalis.